マジレスすると、現金(紙幣)には強制通用力があるから、それに反する取り決めは無効になる可能性が高い。
本来、Apple Storeは出された現金を受け取らざるを得ない。

バイトかなんかが適当に考えた方策だと思うけど…
当局から指導が入ると思うよ。

日本銀行法第46条第2項
「日本銀行が発行する銀行券は、法貨として無制限に通用する」